马季（马国明 饰）多次与死亡擦身而过，一次意外唤醒了沉睡百年的石精灵石敢当，从此打开了天眼，看到凡人看不见的「东西」。一次在石敢当（胡鸿钧 饰）决战邪魔之际，马季意外吸走石敢当的灵力，从此马季成为降魔大师。
曾经贵为香港重案组高级督察的司徒舜（郑嘉颖 饰）过于依赖天眼系统，虽然这种办案方式帮他找到许多破案的关键和证据，却也将他潜入了纵火、毒品的陷阱。为了追查陷害他的真凶，司徒愤而辞职，后在友人介绍下进入一家保安公司担任保安经理，他凭借多年积累的办案知识很快成为该公司的得力干将，在此期间他与新加入公司的郑力行（陈展鹏 饰） 惺惺相惜，情同手足。某次意外，让司徒邂逅私家侦探吴珍妮（杨怡 饰）。这次相遇令司徒重新看到查清纵火真相的希望，同时发现珍妮仿佛拥有某种特殊的能力。
人心，是一门深奥的科学。人会犯罪作恶，皆因被贪婪、愤怒、软弱和嫉妒等情绪支配。为了逃避刑责，人会利用谎言掩饰真相，用诡计扰乱视线，令法证工作难上加难。未破的悬案、消失的证据、迷失的困局，都是法证团队面对的一个个难关。纵然过程中会受到打击，但他们都会坚持初心，跌倒之后重新出发，不会放弃追寻真相。 《法证先锋V》的案件和布局更加让人意想不到，唯有靠着“法证部”、“法医科”及“重案组”这灭罪铁三角，秉承前四季的理念，通力合作，找出真凶，还生者公道，替死者雪冤。
督察戴安娜（宣萱 饰）一直安逸于档案管理的后勤岗位，因缘际会跟元祖级陀枪师姐陈三元（滕丽名 饰）、飞虎队男神蒙汉森（陈豪 饰）合力破案后，被上司韦展超（许绍雄 饰）安排加入悬案小组，与一班各有「特色」的警员，在汉森带领下追查外界不关注的悬案。汉森不满安娜而互相斗法，直至揭露安娜因曾被胁持而恐惧用枪，反令二人擦出爱火花！安娜重遇多年前惨遭灭门的补习学生刘达华（罗子溢 饰），他却加入了黑道……在感情与内疚推动下，安娜能否拿回手枪重新振作，成就新一代的「陀枪师姐」？